Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NSMCE2Q96MF7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms