Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGD4Q96M96 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms