Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms