Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms