Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP9XQ93008 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms