Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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RABGGTAQ92696 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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RABGGTAQ92696 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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RABGGTAQ92696 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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RABGGTAQ92696 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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RABGGTAQ92696 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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RABGGTAQ92696 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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RABGGTAQ92696 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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RABGGTAQ92696 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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RABGGTAQ92696 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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RABGGTAQ92696 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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RABGGTAQ92696 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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RABGGTAQ92696 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RABGGTAQ92696 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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