Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CSRNP3Q8WYN3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSRNP3Q8WYN3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms