Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATAD2BQ8WXI9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms