Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms