Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL22A1Q8NFW1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL22A1Q8NFW1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms