Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARMIL3Q8ND23 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARMIL3Q8ND23 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms