Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNBD1Q8NA66 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms