Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD35Q8N283 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD35Q8N283 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms