Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROM2Q8N271 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROM2Q8N271 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms