Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms