Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLNKQ7Z7G1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms