Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDXQ7Z353 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDXQ7Z353 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms