Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms