Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTF1AQ7RTS3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms