Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP34Q70CQ2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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