Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms