Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD1Q6UXZ0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms