Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCSAPQ6IQ19 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms