Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL3Q6DD88 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms