Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDGFL1Q5TGJ6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDGFL1Q5TGJ6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms