Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms