Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDZK1Q5T2W1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms