Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF2Q5BJF6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms