Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PKDCCQ504Y2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms