Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXO43Q4G163 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO43Q4G163 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms