Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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RTN1Q16799 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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RTN1Q16799 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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RTN1Q16799 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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RTN1Q16799 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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RTN1Q16799 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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RTN1Q16799 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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RTN1Q16799 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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RTN1Q16799 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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RTN1Q16799 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTN1Q16799 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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