Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ME3Q16798 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ME3Q16798 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ME3Q16798 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
ME3Q16798 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ME3Q16798 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ME3Q16798 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ME3Q16798 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ME3Q16798 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME3Q16798 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME3Q16798 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME3Q16798 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME3Q16798 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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ME3Q16798 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME3Q16798 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME3Q16798 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME3Q16798 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME3Q16798 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ME3Q16798 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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ME3Q16798 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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ME3Q16798 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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ME3Q16798 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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ME3Q16798 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME3Q16798 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME3Q16798 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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