Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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