Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms