Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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ECM1Q16610 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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ECM1Q16610 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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ECM1Q16610 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ECM1Q16610 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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