Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SSX1Q16384 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SSX1Q16384 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SSX1Q16384 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SSX1Q16384 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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