Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms