Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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EFNB3Q15768 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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EFNB3Q15768 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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EFNB3Q15768 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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EFNB3Q15768 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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EFNB3Q15768 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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