Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF1Q15361 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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