Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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PTPRRQ15256 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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PTPRRQ15256 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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PTPRRQ15256 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PTPRRQ15256 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PTPRRQ15256 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PTPRRQ15256 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PTPRRQ15256 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PTPRRQ15256 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PTPRRQ15256 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PTPRRQ15256 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTPRRQ15256 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTPRRQ15256 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTPRRQ15256 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRRQ15256 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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