Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms