Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPNMBQ14956 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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