Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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CHD4Q14839 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
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CHD4Q14839 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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CHD4Q14839 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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CHD4Q14839 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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CHD4Q14839 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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