Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms