Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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