Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EBI3Q14213 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EBI3Q14213 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms