Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTB1Q13884 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms