Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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CUL4AQ13619 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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CUL4AQ13619 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL4AQ13619 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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