Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF5Q13568 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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