Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
BFSP2Q13515 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
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